Zabieg sterowanej regeneracji kości jest uprzednio dokładnie planowany, między innymi na podstawie zdjęć RTG. Zabieg odbywa się w znieczuleniu miejscowym, a jego czas trwania jest zależny od tego, jaką ilość kości należy odbudować. Podczas zabiegu rozcinane jest dziąsło i lekarz dostaje się do kości, której brakuje. Nakłada na nią materiał kościotwórczy i membranę zaporową, która ma chronić materiał kościotwórczy przed przemieszczeniem się i przed dostaniem się do niego tkanek miękkich. Po założeniu membrany rana jest zszywana, a w ciągu około 6 miesięcy kość regeneruje się i odbudowuje.